Protein–RNA interactions for Protein: O35709

Enc1, Ectoderm-neural cortex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Enc1O35709 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Enc1O35709 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Enc1O35709 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms