Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp3O35609 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms