Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Npc1O35604 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Npc1O35604 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Npc1O35604 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Npc1O35604 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Npc1O35604 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Npc1O35604 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Npc1O35604 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Npc1O35604 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Npc1O35604 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Npc1O35604 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Npc1O35604 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Npc1O35604 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Npc1O35604 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Npc1O35604 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Npc1O35604 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Npc1O35604 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms