Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptch2O35595 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms