Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Edil3O35474 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edil3O35474 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms