Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kpna3O35344 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms