Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpna4O35343 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna4O35343 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna4O35343 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna4O35343 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna4O35343 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna4O35343 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna4O35343 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna4O35343 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms