Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Kcns1O35173 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Kcns1O35173 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Kcns1O35173 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Kcns1O35173 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Kcns1O35173 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcns1O35173 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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