Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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