Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema3aO08665 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema3aO08665 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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