Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AlyrefO08583 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms