Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MsmbO08540 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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MsmbO08540 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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MsmbO08540 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MsmbO08540 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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MsmbO08540 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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MsmbO08540 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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MsmbO08540 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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MsmbO08540 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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MsmbO08540 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MsmbO08540 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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