Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm2056J3QQ02 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm2056J3QQ02 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm2056J3QQ02 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm2056J3QQ02 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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