Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm5849J3QPE5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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