Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim22J3QP37 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim22J3QP37 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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