Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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