Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc180J3QNE4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms