Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK1

Sgo2b, Shugoshin 2B, mousemouse

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Length 1,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2bJ3QMK1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo2bJ3QMK1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo2bJ3QMK1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo2bJ3QMK1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo2bJ3QMK1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo2bJ3QMK1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo2bJ3QMK1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo2bJ3QMK1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgo2bJ3QMK1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sgo2bJ3QMK1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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