Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20825J3QM67 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20825J3QM67 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20825J3QM67 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20825J3QM67 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20825J3QM67 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20825J3QM67 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20825J3QM67 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20825J3QM67 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20825J3QM67 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20825J3QM67 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20825J3QM67 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20825J3QM67 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20825J3QM67 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20825J3QM67 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20825J3QM67 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms