Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3727J3QM54 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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