Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms