Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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