Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21411J3KMS0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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