Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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