Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp17ldG5E8G2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp17ldG5E8G2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms