Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r34G3XA52 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms