Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms