Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms