Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rhox13F6YCR7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms