Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crocc2F6XLV1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms