Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28374F6SG70 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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