Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051665E9Q623 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051665E9Q623 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BC051665E9Q623 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC051665E9Q623 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms