Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FancfE9Q5Z5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms