Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
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ApobE9Q414 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
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ApobE9Q414 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.92
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ApobE9Q414 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
ApobE9Q414 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
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ApobE9Q414 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
ApobE9Q414 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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