Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms