Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm3250E9Q1M3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms