Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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