Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo5cE9Q1F5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms