Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20425E9Q035 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms