Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddx60E9PZQ1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddx60E9PZQ1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms