Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srp54bE9PXC0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srp54bE9PXC0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms