Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cngb1E1AZ71 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
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