Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20521D3Z5F7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm20521D3Z5F7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms