Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms