Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms