Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms