Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm17333C6EQI3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm17333C6EQI3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm17333C6EQI3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm17333C6EQI3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm17333C6EQI3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Gm17333C6EQI3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm17333C6EQI3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm17333C6EQI3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm17333C6EQI3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm17333C6EQI3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm17333C6EQI3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17333C6EQI3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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