Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cspp1B2RX88 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms