Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ankrd34aB2RW11 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd34aB2RW11 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms