Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Trabd2bB1ATG9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Trabd2bB1ATG9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Trabd2bB1ATG9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trabd2bB1ATG9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trabd2bB1ATG9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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